Protein kedelai adalah protein yang diisolasi dari kedelai. Protein ini terbuat dari bungkil kedelai yang telah dikupas dan dihilangkan lemaknya. Kedelai yang telah dikupas dan dihilangkan lemaknya diolah menjadi tiga jenis produk komersial berprotein tinggi: tepung kedelai, konsentrat, dan isolat, yang digunakan dalam produksi pangan dan industri.

Protein kedelai secara umum dianggap terkonsentrasi dalam badan protein, yang diperkirakan mengandung setidaknya 60–70% dari total protein kedelai. Setelah kedelai berkecambah, protein akan dicerna, dan asam amino yang dilepaskan akan diangkut ke lokasi pertumbuhan bibit.